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Título
Métodos de Controle Ótimo dos Processos Dinâmicos do Enovelamento de Proteínas
Linha de pesquisa
Otimização
Tipo de publicação
Dissertação de Mestrado
Número de registro
Data da defesa
6/7/2015
Resumo

O presente trabalho se utiliza de técnicas de controle ótimo, uma ferramenta matemática muito potente, baseada no Princípio de Máximo de Pontryagin, para analisar dinâmicas da estrutura de proteínas. A partir de um modelo dinâmico para os átomos encontrados na espinha dorsal do polipeptídeo, analisam-se as consequências de consideração de uma dinâmica controlada por métodos de controle ótimo. São analisados dois casos. No primeiro, o termo inercial é considerado como pequeno diante do termo de fricção. No segundo caso, as diferençaas entre as massas dos sítios atômicos são consideradas como sendo pequenas.

Abstract

This work uses optimal control techniques, a very powerful mathematical tool based on Pontryagin's Maximum Principle, to analyze the dynamics of proteins' molecular structure. From a dynamical model for the polypeptide backbone's atoms, the consequences of the consideration of a controlled dynamic by optimal control methods are analyzed. Two different cases are analyzed. In the rst, the inertial term is considered negligible compared to the friction term. In the second case, the differences between the atoms' sites are considered very small.

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