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Informações:

Publicações do PESC

Título
Verificação da Existência de Padrões de Entropia entre Famílias e Clãs nas Versões do Pfam
Linha de pesquisa
Otimização
Tipo de publicação
Dissertação de Mestrado
Número de registro
Data da defesa
21/3/2025
Resumo

Este estudo tem como objetivo investigar os padrões de evolução das famílias de proteínas entre as versões 28 e 35 do banco PFAM, com uma análise detalhada das mudanças ocorridas no contexto das estruturas de clãs. O trabalho abrange famílias que permaneceram no mesmo clã ao longo das versões, aquelas que foram realocadas para clãs distintos e, ainda, famílias que foram descontinuadas durante o período analisado. Utilizando parâmetros como valores de entropia e gráficos baseados na teoria de Sharma-Mittal, a análise explora as colunas específicas de alinhamento múltiplo de sequências para detectar variações significativas ou estabilidade em termos de padrões evolutivos. A investigação também inclui comparações entre parâmetros r e s, avaliando a distribuição de valores e curvas que refletem as relações entre os elementos das famílias de proteínas.

Abstract

This study aims to investigate the evolutionary patterns of protein families across versions 28 to 35 of the PFAM database, providing a detailed analysis of the changes within clan structures. The work focuses on families that remained within the same clan across versions, those that were reassigned to different clans, and families that were discontinued during the analyzed period. Using parameters such as entropy values and Sharma-Mittal theory-based graphs, the analysis examines specific columns of multiple sequence alignments to identify significant variations or stability in evolutionary patterns. Comparisons of r and s parameters are also included, evaluating the distribution of values and curves that reflect relationships among the elements of the protein families.

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